药师佛之形像，据药师琉璃光王七佛本愿功德念诵仪轨供养法载，左手执持药器（又作无价珠），右手结三界印，著袈裟，结跏趺坐于莲花台，台下有十二神将。此十二神将誓愿护持药师法门，各率七千药叉眷属，在各地护佑受持药师佛名号之众生。　

十二药叉神将为眷属，依次为有宫毗罗大将、跋折罗大将、迷企罗大将、頞你罗大将、末你罗大将、娑你罗大将、因陀罗大将、 婆夷罗大将、薄呼罗大将、真达罗大将、朱社罗大将、毗羯罗大将， 此十二大将各有七千药叉以为眷属。眷属药叉十二神将，表药师佛的神威力，时刻都守护行者。药师佛有五十一种身相示现，通常指的是八大药师佛。

又一般流传之像为螺发形，左手持药壶，右手结施无畏印（或与愿印），药师琉璃光如来二胁侍菩萨，一为日光菩萨，二为月光菩萨；此二胁侍在药师佛之净土为无量众中之上首，是一生补处之菩萨，表示不分昼夜教化众生之意；

亦有以观音、势至二菩萨为其胁侍者。此外，或以文殊师利、观音、势至、宝坛华、无尽意、药王、药上、弥勒等八菩萨为其侍者。　

药师佛的净土为“东方净琉琉璃世界”，故又称琉璃光佛，以琉璃蓝为其肤色，具法身佛之相。一面二臂，以吠琉璃蓝为其肤色，身穿三衣，右手施愿印持持药诃子，左手脱药钵，钵内贮满能治众生因果上一切诸病之妙甘露，具三十二相，八十随好，以金刚跏趺姿安住于莲花月轮宝座上。

药师佛在因地修持行菩萨道时，曾发十二大愿：
一、自身光明照无边界；
二、身如琉璃内外清澈；
三、令诸有情悉皆圆满；
四、令一切众生行者安住大乘法宗；
五、令诸有情修行梵行如法清净；
六、诸根不具者皆得端严；
七、令诸有情身心安乐乃至菩提；
八、由女身转男身；
九、令诸有情消除外道邪见修习诸菩萨行；
十、令诸有情解脱一切忧苦；
十一、令诸有情随意饱满令住安乐；
十二、令诸有情得种种上妙衣服无诸苦恼。

此十二微妙上愿使众生得现世安乐。要让众生今世生活于安乐无病苦之中，使具足诸根，导入解脱，故依此愿而成佛，住净琉璃世界，其国土庄严如极乐国。释迦牟尼佛因此开示药师佛法门，利益后世众生。

以药师佛表相而言，乃是为救济一切众生的病苦，实相则是为医治一切众生的病源–根本无明的痼疾，度化众生能够脱离生死的轮回，所以被尊为大医王佛或医王善道。

药师佛誓愿不可思议，若有人身患重病，死衰相现，眷属于此人临命终时昼夜尽心供养礼拜药师佛，读诵药师如来本愿功德经四十九遍，燃四十九灯，造四十九天之五色彩幡，其人得以苏生续命。此种药师佛之信仰自古即盛行。　

依唐代义净译药师琉璃光七佛本愿功德经载，药师佛又作七佛药师。主尊药师佛，身如琉色，具足光明，披三法衣。右手结胜施印，持带叶的"如拉"（藏青果） ，左手托钵，贮满能治众生由因果所生的诸病之甘露妙药。相好圆满，以金刚双跏趺坐在莲花月轮之上。

因尚未开悟的众生都会有各种烦恼困扰骚乱身心，特别是贪、嗔、痴等，相互混合而产生繁杂的四万八千种不同烦恼，煎迫那些为开悟的众生。由于心理方面有如此多的烦恼，因而导致生理方面有四百零四种的传统疾病和失调，使身体受到病苦之乱。药师佛愿力的显现是消除这些烦恼，使免于受其苦，故持念本尊咒语或药师佛本愿功德经轨，并作礼敬供养，不但可消灾延寿，灭除一切灾劫病苦外，于命终时并可往生清净琉璃世界–药师佛净土。

礼敬供养药师佛，念佛名号，诵其咒语，可消除一切诸病苦之烦恼根源，为十二之根本显示。还可消灾延寿，减除灾害病苦，免除九横死之灾。 药师佛为大医王佛，发十二誓愿，救众生之病源，治无明之痼疾。并能消除一切灾业。